具備生物特征辨識功能的電子護照的外觀和傳統(tǒng)護照沒什么兩樣，只是護照最后一頁嵌入芯片，芯片內除了儲存護照上各項基本數(shù)據(jù)，例如護照本人的電子文件，還存有其各項生物特征數(shù)據(jù)，如臉部特征，未來可能指紋及虹膜也包括在內。

除了具備防偽功能，新護照還應用無線射頻識別技術(RFID)，這就像搭捷運時使用悠游卡，在匣門通道上“嗶”一聲，利用電磁感應方式讀取數(shù)據(jù)，有助于旅客快速通關，這項系統(tǒng)類似傳統(tǒng)護照上的條形碼或磁條，但最大不同是能夠長距離讀取，一次讀取數(shù)百筆數(shù)據(jù)，節(jié)省大量時間。

外交部表示，為了便于本國旅客快速通關，移民署也在發(fā)展“自動通關系統(tǒng)”，第一道匣門先確認護照是否為本人，第二道匣門再確認是否遭限制出入境，不過，臺灣當局規(guī)范相關護照芯片的使用方式，尚未完成立法程序，外交部已提出《護照條例修正草案》并交付立院審查，取得國人芯片植入護照的法源依據(jù)。