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亞馬遜云科技人工智能與機器學習技術(shù)助力科學家繪制完整的腦部地圖

2023-07-24 14:30 美通社

導讀:北京2023年7月24日 -- 雖然神經(jīng)科學家已研究了數(shù)十年,但阿爾茨海默癥和帕金森癥等腦部疾病的治療方法仍舊進展緩慢,其原因在于腦部是人體中最復雜、最難了解的器官。關(guān)于腦部研究的數(shù)據(jù)集雖然數(shù)量眾多,但卻離散多元,而且通常不能夠用統(tǒng)一的科學語言來描述。

北京2023年7月24日 -- 雖然神經(jīng)科學家已研究了數(shù)十年,但阿爾茨海默癥和帕金森癥等腦部疾病的治療方法仍舊進展緩慢,其原因在于腦部是人體中最復雜、最難了解的器官。關(guān)于腦部研究的數(shù)據(jù)集雖然數(shù)量眾多,但卻離散多元,而且通常不能夠用統(tǒng)一的科學語言來描述。

艾倫腦科學研究所助理研究員Rebecca Hodge博士(Erik Dinnel拍攝,艾倫研究所)
艾倫腦科學研究所助理研究員Rebecca Hodge博士(Erik Dinnel拍攝,艾倫研究所)

"盡管投入了大量資金,但我們尚未找到解決主要腦部疾病的方法"艾倫研究所腦科學高級研究員Ed Lein表示,"我們擁有大量信息,但這些信息沒有經(jīng)過整合或很難綜合處理。"

在美國國立衛(wèi)生研究院(NIH)的資助和亞馬遜云科技技術(shù)的支持下,艾倫研究所正在領(lǐng)導腦知識平臺(Brain Knowledge Platform),以期解決這一問題。

腦知識平臺工作的一部分是繪制一張全新的、精確到單個細胞的完整腦部地圖,這項工作由Lein和來自世界各地的17家研究機構(gòu)的神經(jīng)科學研究人員主導。此外,艾倫研究所數(shù)據(jù)和技術(shù)主管Shoaib Mufti帶領(lǐng)團隊與亞馬遜云科技合作,將利用這張腦圖創(chuàng)建全球最大的腦細胞開源數(shù)據(jù)庫。這是人類首次對關(guān)于哺乳動物大腦結(jié)構(gòu)和功能的大規(guī)模數(shù)據(jù)集進行匯編和標準化。

這個項目致力于更好地診斷和治療精神和神經(jīng)疾病,這些疾病影響美國五分之一以上人口,每年給美國造成1.5萬億美元的經(jīng)濟損失。

Lein表示:"化學有元素周期表,基因組學有極具變革性的人類基因組圖,神經(jīng)科學也要有類似的基礎(chǔ)資源,腦知識平臺將幫助創(chuàng)建這一資源。"

艾倫研究所腦科學高級研究員Ed Lein博士(Erik Dinnel拍攝,艾倫研究所)
艾倫研究所腦科學高級研究員Ed Lein博士(Erik Dinnel拍攝,艾倫研究所)

該平臺的核心是單細胞基因組學。有了測量單個腦細胞基因的新技術(shù),研究人員現(xiàn)在可以更好地了解大腦細胞的復雜性以及賦予細胞獨特功能的基因。這些高度詳實的細胞圖譜將幫助研究人員了解疾病的起源,并最終助力臨床醫(yī)生準確找出阿爾茨海默癥和帕金森癥等疾病的成因。

"研究人員將通過這一知識平臺獲得現(xiàn)有基礎(chǔ)設(shè)施無法提供的新發(fā)現(xiàn)。"Mufti表示,"一旦分散的信息碎片相互連接,我們就可以將健康大腦的數(shù)據(jù)與患病大腦的信息關(guān)聯(lián)起來——這將釋放巨大潛力。"

該平臺還能關(guān)聯(lián)不同物種的腦部研究,Lein預計該知識圖譜最終將能夠整合所有哺乳動物的生物學信息。

將腦部約2000億個細胞產(chǎn)生的數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)變?yōu)榭纱鎯Α⒎治龊驮L問的開源工具的正是云計算。基于此,臨床醫(yī)生或?qū)⒛軌蛘业侥X疾病的治療方法。亞馬遜云科技的高性能計算能力和Amazon SageMaker幫助艾倫研究所管理所有數(shù)據(jù),并且可跨多個工作負載進行擴展。艾倫研究所正在使用亞馬遜云科技的人工智能(AI)和機器學習(ML)服務(wù),并計劃在未來部署生成式AI,將龐大、復雜、多模態(tài)的數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)化為洞察。

艾倫腦科學研究所的研究人員(Erik Dinnel拍攝,艾倫研究所)
艾倫腦科學研究所的研究人員(Erik Dinnel拍攝,艾倫研究所)

"通過亞馬遜云科技機器學習技術(shù),利用專門構(gòu)建的AI服務(wù),研究機構(gòu)能夠找出新的關(guān)聯(lián)和發(fā)現(xiàn)。"亞馬遜云科技非營利健康事業(yè)董事總經(jīng)理Allyson Fryhoff表示,"艾倫研究所正在使用機器學習等先進的云技術(shù),以經(jīng)濟高效且可擴展的方式進一步加速科研發(fā)現(xiàn)。他們致力于探尋人類大腦未解之謎,這樣的勇氣令我們印象深刻,我們也期待著腦研究未來能有新的突破。"

美國密蘇里州圣路易斯華盛頓大學神經(jīng)科學教授、艾倫研究所的研究合伙人David Van Essen從事大腦研究已經(jīng)50多年。他將大腦研究的加速變化比作地圖的演變。

"幾個世紀前,我們的地圖雖然五顏六色,但卻相當粗淺,只反映出當時人們對地球表面的認知。那時的制圖師只是大致知道大陸和島嶼的方位,以及主要的地理和政治區(qū)域劃分,但并不十分準確。"Van Essen表示,"近年來,信息爆炸以及衛(wèi)星圖像技術(shù)的進步,使導航工具越來越準確和方便。我們也渴望在人腦研究領(lǐng)域繪制越來越細致的地圖,使它成為治療大腦疾病強有力的導航工具。"

Lein和他的團隊剛剛啟動了這項為期五年的人腦地圖繪制項目,與之前的人類基因組計劃非常相似,該項目有可能為包括神經(jīng)科學在內(nèi)的所有醫(yī)學領(lǐng)域打開新的發(fā)現(xiàn)之門。